Институт истории материальной культуры Российской академии наук (далее – ИИМК РАН) провел научно-исследовательские археологические работы в виде закладки разведывательных шурфов на территории, ограниченной Митрофаньевским шоссе, Малой Митрофаньевской улицей и Старообрядческой улицей. Работы проводились в рамках хозяйственного договора № ИАР-1 от 04.12.2013 между Комитетом по развитию транспортной инфраструктуры города Санкт-Петербурга и ИИМК РАН. Но по заявлению Министерства культуры Российской Федерации разрешение на право проведения археологических полевых работ на территории Митрофаньевского православного и лютеранского кладбища города Санкт-Петербурга не выдавалось. Однако Министерство культуры Российской Федерации выдало разрешение №1706 на право проведения археологических разведок на участке строительства на Новоизмайловском проспекте, ограниченном Митрофаньевским шоссе, Малой Митрофаньевской улицей и Старообрядческой улицей. Вышеуказанная территория и есть большая часть Митрофаньевского некрополя.
Депутат Анохин просит провести проверку законности такого разрешения. Также Андрей Анохин считает, что проводимая на территории исторического некрополя  археологическая разведка подпадает под статью 244 Уголовного кодекса Российской Федерации «Надругательство над телами умерших и местами их захоронения».

Подробнее см. Незаконная археологическая разведка на Митрофаньевском кладбище